榛属ycf1基因生物信息学分析

卫永乐;温志芳;刘芳;张杰伟;黄武刚;兰彦平;程丽莉;曹庆昌;胡广隆

运城农业职业技术学院;北京市农林科学院

摘  要：

为研究ycf1基因家族成员在榛属(Corylus)中的生理功能,利用榛属叶绿体基因组数据库,经过生物信息学分析,获得榛属ycf1基因家族成员的基因结构、定位和编码蛋白,经过多重序列比对进行进化和分类分析。结果表明,榛属叶绿体基因组中的ycf1基因家族成员不含有内含子;TMHMM跨膜区结构分析显示,榛属YCF1蛋白均不含有跨膜区;MEME保守结构域分析显示,榛属YCF1蛋白均含有3个保守结构域。研究结果对解析榛属YCF1蛋白的生物学功能提供重要的线索。

关键词：ycf1基因;榛属;基因家族;进化分析