西藏石榴野生群体的SSR遗传多样性分析

葛大朋;任媛;赵俊;王玉婷;刘学庆;苑兆和

山东省烟台市农业科学研究院;西藏自治区林木科学研究院;南京林业大学

摘  要：

[目的]调查西藏地区野生石榴种质资源,分析西藏野生石榴群体的遗传多样性和遗传结构,为野生石榴资源的保护和利用提供理论依据.[方法]使用13对SSR引物对3个自然群体共42份西藏地区野生石榴种质资源材料DNA进行PCR扩增,毛细管电泳检测扩增片段长度,使用GenAlEx和Arlequin等软件对SSR数据进行分析.[结果]13对引物共检测到44个等位基因,平均3.385个,引物的平均有效等位基因数(Ne)、香农信息指数(I)、期望杂合度(He)和多态信息量(PIC)分别为1.971、0.771、0.481和0.393.3个野生群体的平均有效等位基因数(Ne)、平均香农信息指数(I)和平均期望杂合度(He)分别为1.867、0.646和0.421,林芝b(LZb)群体的遗传多样性水平高于其他2个群体.AMOVA分析表明,群体内遗传变异高达88.43%,3个群体间的遗传分化系数(Fst)为0.116.种质聚类分析将供试种质划分为3个亚群,结果与种质地理来源具有一定关联性.遗传结构分析显示西藏野生石榴有4个可能的基因库来源.[结论]13对SSR引物可用于西藏野生石榴种质的遗传多样性等研究.西藏野生石榴种质的遗传变异主要存在于群体内;林芝b(LZb)群体遗传多样性最高,遗传结构复杂,且含有最多的野生种质采样点,可予以优先保护.

关键词：石榴野生群体;SSR;遗传多样性;遗传结构;西藏