健康与感染黑胫病烟株根际土壤细菌群落结构与多样性
昆明学院/云南省都市特色农业工程技术研究中心;云南省烟草公司曲靖市公司;云南省宣威市农业技术推广中心;河南中烟工业有限责任公司原料采购中心
- 摘 要：
- [目的]探究健康与感染黑胫病烟株根际土壤的细菌群落结构差异,为该病害的早期预防或生态调控提供科学依据.[方法]利用Illumina MiSeq高通量测序技术分析健康烟株与感染黑胫病烟株根际土壤细菌群落结构差异.[结果]健康和患病烟株根际土壤样品中细菌OTU数分别为4763个和4653个.感染黑胫病烟株根际土壤OTU总数较健康烟株菌根际土壤减少2.31%,特有OTU数减少3%.与健康烟株根际土样相比感染黑胫病烟株根际土壤细菌群落多样性水平明显下降.患病烟株根际土壤的Shannon、ACE和Chao1指数分别较健康植株降低了3.05%、21.29%、15.23%.同时,感染黑胫病烟株与健康烟株根际土壤细菌菌群落的优势物种显著不同,感染黑胫病烟株根际土壤中拟杆菌门(Bacteroidota)和粘球菌门(Myxococcota)相对丰度减少59.13%、20.38%;厚壁菌门(Firmicutes)、Methylomirabilota相对丰度分别增加了34.17%、117.19%.属水平上,在健康烟株根际土壤样本中为优势菌属的类诺卡氏菌属(Nocardioides,4.99%)在感染黑胫病烟株土壤样本中未检测到.[结论]烟草植株根际土壤中细菌群落结构改变及物种多样性降低是烟草黑胫病发生的重要特征.
关键词：烟草黑胫病;细菌群落结构;根际土壤;多样性
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