菊花和菊花脑DNA甲基化相关酶基因鉴定及表达分析
河南大学生命科学学院
- 摘 要：
- 基于传统菊花(Chrysanthemum×morifolium Ramat.)品种'金背大红'转录组数据和菊花脑(C.nankingense)的基因组数据,通过生物信息学方法鉴定了二者的DNA甲基化相关酶基因,分析其编码蛋白结构域并构建系统发育树,还分析了基因的表达情况.从'金背大红'中鉴定出了 13个DNA甲基转移酶基因和11个去甲基化酶基因,从菊花脑中鉴定出10个DNA甲基转移酶基因和5个去甲基化酶基因.MET1同源氨基酸序列系统进化分析结果表明,菊花'紫精灵''金背大红'和'禾城星火'与甘菊[C.lavandulifolium(Fisch.ex Trautv.)Ling et Shih]处于较近的分支中,这表明他们可能有更近的演化关系,而菊花脑和菊花'泉乡水长'与甘菊的进化关系可能较远.DNA甲基化相关酶基因在不同组织及不同菊花品种中的表达水平存在较大差异.
关键词：菊花;DNA甲基化;DNA甲基转移酶;DNA去甲基化酶;基因鉴定;表达
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