不同剩余采食量水平的安格斯牛下丘脑单核苷酸多态性和可变剪接分析
宁夏大学农学院
- 摘 要：
- [目的]揭示可变剪接事件参与调控肉牛剩余采食量(residual feed intake,RFI)水平的潜在作用,提高肉牛饲料利用率.[方法]利用Illumina技术对2个RFI水平(高/低)的安格斯牛下丘脑组织进行高通量测序,分别进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism site,SNPs)和可变剪接(alternative splicing,AS)分析,同时对差异表达AS相关基因进行功能富集.[结果]2个RFI水平组共检测到SNP数量48227~1000092个,其中转换型突变所占比例最高.AS分析发现,共有12385个可变剪接基因的35463个AS事件,有426个显著差异表达AS相关基因对应498个AS事件,其中外显子选择性跳跃类型AS事件所占比例最大,占总数的85.33%.KEGG通路富集分析表明,差异表达AS相关基因主要富集到胰岛素信号通路、催乳激素信号通路、胆碱代谢、mTOR信号通路、cAMP信号通路、ErbB信号通路和昼夜节律等,表明这些差异表达AS相关基因在肉牛RFI表型变异中发挥重要作用.[结论]通过分析2个RFI水平(高/低)的安格斯牛下丘脑组织表达基因的遗传变异及AS事件,为后续开展肉牛RFI相关基因功能分析与挖掘提供有效数据和理论基础.
关键词：安格斯牛;剩余采食量;下丘脑;单核苷酸多态性;可变剪接
相似文章
-
安格斯牛的种质资源利用现状 [丁得利, 韩永胜, 李伟, 李青莹, 姚美玲, 林秀蔚] 现代畜牧科技 2022,88 (4) 15-17
-
宁夏地区安格斯牛育种目标性状确定及边际效益分析 [冯小芳, 封元, 王瑜, 蒋秋斐, 母童, 虎红红, 陈亚飞, 周子航, 王影, 蔡正云, 顾亚玲] 中国农业大学学报 2022,27 (4) 195-206
-
澳大利亚进口安格斯牛的应激疾病防治技术 [鲁金强, 邓成松, 们有贤, 杨国荣] 养殖与饲料 2022,21 (2) 75-77
-
东北地区安格斯牛饲养管理技术措施 [丁得利, 韩永胜, 李伟, 李青莹, 姚美玲, 林秀蔚] 现代畜牧科技 2022 (3) 64-65
-
不同处理方案对安格斯牛同期发情效果的影响 [岳成广, 蒋守箐, 王杰, 黄飞, 刘书东, 高庆华] 中国草食动物科学 2022,42 (2) 81-84
-
安格斯牛的引进、研究利用及其产业发展现状 [赵晓川, 刘利, 卜也, 王金柱, 孟详人, 许珊珊, 孙芳] 黑龙江动物繁殖 2022 (1) 26-29,33
-
安格斯牛UCP2和UCP3基因组织表达规律研究 [张娟, 冯小芳, 母童, 虎红红, 马正旭, 黄增文, 王影, 顾亚玲, 蔡正云] 安徽农业大学学报 2021 (5) 777-783
-
舍饲安格斯牛场犊牛成活率不高的原因及对策 [王建梅, 代佳君, 刘贤侠, 苏政, 董升雷, 时利军, 玛合萨提] 中国牛业科学 2020,46 (6) 63-67
-
喀什地区安格斯牛"公司+农户"饲养模式效果分析 [吕长鹏, 伊力亚斯·依米提, 廖干, 善刚, 马富富, 姚恩平] 中国牛业科学 2021,47 (6) 56-57
-
不同年龄阶段安格斯牛与湘西黄牛屠宰性能和肉品质的比较 [孙鏖, 雷虹, 何芳, 李剑波, 浣成, 张佰忠, 易康乐] 南方农业学报 2021 (4) 1116-1123
