甘蔗类质子梯度调节蛋白基因的生物信息学及表达分析
福建农林大学;玉林师范学院农学院
- 摘 要：
- PGR5(Proton gradient regulation 5)/PGRL1(Proton gradient regulation like 1)介导的环式电子传递(cyclic electron transfer,CET)在高等植物调节光合作用、缓解光抑制过程中起着重要作用.目前,在甘蔗(Saccharum spp.)中还未见关于PGRL1的研究.本研究克隆得到一个甘蔗ScPGRL1基因(GenBank accession number:MT747432),生物信息分析结果显示,ScPGRL1包含一个983 bp的完整开放阅读框,编码327个氨基酸的不稳定酸性蛋白.ScPGRL1蛋白主要由无规则卷曲、α-螺旋和延伸链组成,具有ATP合酶活性位点、肽配体结合位点和两个跨膜区.系统进化树分析表明,甘蔗ScPGRL1与高粱和玉米PGRL1在系统发育分支中距离最近,且"GPRCS"氨基酸序列及PGRL1蛋白的两个跨膜区在植物进化过程中保守.亚细胞定位结果表明,ScPGRL1定位于细胞膜和叶绿体.实时荧光定量PCR分析表明,ScPGRL1基因在茉莉酸甲酯胁迫下被显著诱导表达,在双氧水胁迫下被显著抑制表达.本研究为深入研究ScPGRL1基因的功能和作用模式奠定了基础.
关键词：甘蔗;PGRL1;生物信息学;光抑制;亚细胞定位
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