多毛番茄CIPK基因家族生物信息学分析及低温下功能研究
东北农业大学生命科学学院;东北农业大学园艺园林学院
- 摘 要：
- CIPK基因家族是Ca2+介导的植物信号转导途径中的一个关键家族,在植物胁迫响应和生长中起着关键作用.本试验基于多毛番茄全基因组数据筛选出24个多毛番茄CIPK基因家族成员,系统进化分析将家族成员分为5个亚组,家族成员内部含有5个基因复制对.亚细胞定位分析表明,多毛番茄CIPK基因大多定位于细胞质;少数分布于质膜、细胞核、线粒体.共线性分析结果表明,拟南芥和栽培番茄中的CIPK基因家族中分别有14个和12个基因与多毛番茄存在共线性关系.顺式作用元件分析结果表明,多毛番茄CIPK基因家族基因含有光、激素、冷胁迫等相关的元件.实时荧光定量PCR结果表明,低温胁迫下ShCIPK2、ShCIPK17、ShCIPK19表达量显著提高,推测这3个基因可能在多毛番茄低温胁迫应答中起重要的作用.
关键词：多毛番茄;CIPK;生物信息学;低温
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