番鸭呼肠孤病毒非结构基因的克隆和序列分析
哈尔滨市兽医卫生防疫站黑龙江哈尔滨;中国农业科学院哈尔滨兽医研究所生物技术国家重点实验室;福建农科院牧医所
- 摘 要：
- 参考GenBank禽呼肠孤病毒 (AvianReovirus,ARV)和番鸭呼肠孤病毒 (MuscovyDuckReovirus,MDRV)非结构基因 (NS)序列设计合成一对引物 ,对番鸭呼肠孤病毒S14和C4株NS基因进行RT_PCR扩增 ,克隆到pMD18_T载体中 ,并对克隆产物进行酶切鉴定和测序 ;番鸭呼肠孤病毒NS基因由 12 91bp核苷酸组成 ,与禽呼肠孤病毒NS基因相比 ,在非编码区第 115 5位少一个碱基 ,本文第一次证实 12 91bp是番鸭呼肠孤病毒NS基因特有的长度 ;番鸭呼肠孤病毒S14和C4株NS基因的 5’末端和 3’末端分别为 5‘GCTTTTT和TCATC_3’ ,是禽类呼肠孤病毒基因末端特有的碱基序列 ,S14和C4株NS基因的的有效阅读框 (2 4～ 112 7bp)编码 36 7个氨基酸组成的蛋白 ,分子量约为 4 0kDa ;番鸭呼肠孤病毒S14和C4株NS蛋白等电点分别是 7.3和 7.0 ,GC含量分别为 5 4 .2 6 %和 5 3.71% ,番鸭呼肠孤病毒S14和C4株NS基因间核苷酸同源性为 99.3% ,仅有 4个氨基酸差异 ,S14和C4与法国番鸭呼肠孤病毒 890 2 6株NS基因核苷酸同源性分别为 87.8%和 87.9% ,与鸡关节炎病毒S1133NS基因同源性分别为 79.0 %和 79.3% ;进化树分析表明本研究中的两株番鸭呼肠孤病毒非结构基因 (NS)与番鸭呼肠孤病毒的亲缘关系比禽呼肠孤病毒近的多 ,建议番鸭呼肠孤病毒应归属为正呼肠孤?
关键词：番鸭呼肠孤病毒;NS基因;克隆;序列分析
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