铁皮石斛蛋白磷酸酶PP2C家族基因鉴定及其表达分析
海南大学林学院热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室海南省热带特色花木资源生物学重点实验室;海南大学园艺学院海南省热带园艺作物品质调控重点实验室海南省耐盐作物生物技术重点实验室
- 摘 要：
- 利用生物信息学方法对铁皮石斛（Dendrobium catenatum Lindl.）2C型蛋白磷酸酶（protein phosphatase 2C,PP2C）家族基因进行鉴定分析,采用实时荧光定量PCR技术分析PP2C基因的组织表达特性,以及在不同非生物胁迫和植物生长调节剂处理下的表达模式。共鉴定出67个家族成员,其编码的氨基酸在80～1 075 aa之间,分子量在8.86～119.59 kD之间,等电点在4.13～9.36之间。进化树分析可将其分为13个亚族,且每个亚族蛋白的保守基元相似。基因结构分析表明,PP2C基因的外显子数量为1～15不等。空间表达模式分析发现有4个PP2C在铁皮石斛合蕊柱中表达量最高,5个基因在蒴果中表达量最高,有1个基因在根中表达量最高,PP2C的表达具有组织特异性。DcPP2C5、DcPP2C20和DcPP2C56表达量受干旱胁迫（20%PEG6000）上调较明显,DcPP2C24受高温（42℃）诱导最显著,DcPP2C5受低温（4℃）诱导上调表达,DcPP2C20受到盐胁迫（200 mmol·L-1 NaCl）诱导,这些基因的表达均在不同程度上受100μmol·L-1ABA和20μmol·L-1 SA的诱导,说明它们在铁皮石斛应对逆境胁迫中发挥作用。
关键词：铁皮石斛;蛋白磷酸酶PP2C;非生物胁迫;植物生长调节剂;表达分析;
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