亚洲栽培稻遗传变异分析最少SSR引物数的研究
中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室
- 摘 要:
- 以69份类型明确的亚洲栽培稻品种为材料,选用120对SSR引物,通过评估遗传多样性和群体结构,研究分析其遗传变异对SSR引物数的要求。结果表明:1)120对引物在69份试验材料中共检测到1256个等位变异,每个位点的等位基因数差异较大,变化范围为2~27,平均为10.5;平均Nei基因多样性指数变化范围为0.4058~0.9452,平均为0.7616;2)分析亚洲栽培稻遗传多样性时,至少需要72对SSR引物;3)分析亚洲栽培稻群体结构时所需最少引物数可降低至60对。
关键词:亚洲栽培稻;SSR标记;遗传多样性;群体结构;矩阵相关性检测
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