苎麻kinesin基因家族全基因组鉴定与表达分析

于娜;陈晓蓉;石亚亮;牛娟;陈静;钟意成;陈建华;孟超敏;栾明宝

中国农业科学院麻类研究所/农业农村部麻类生物学与加工重点实验室;河南科技大学农学院;江西省麻类研究所

摘  要：

驱动蛋白(Kinesin)家族是一类蛋白质超家族,属于分子马达蛋白中非常重要的一种,参与细胞分裂、生长和形态发生等植物生长发育过程.文章通过生物信息学方法,从苎麻全基因组中鉴定得到57个kinesin基因家族成员,依据苎麻基因注释的结果将其命名,所有kinesin蛋白均含有KISc结构域.苎麻kinesin蛋白的分子量分布范围为15893.8~325534.9 Da,氨基酸大小为142~2857 aa,等电点范围在4.79~10.44,外显子个数为3~42.顺式作用元件预测结果分析表明,BnKINs含有茉莉酸甲酯、赤霉素、脱落酸、生长素、水杨酸等激素响应元件.qRT-PCR结果发现,大多数基因在节间完全伸长区的茎皮中表达量较高.该研究为苎麻kinesin家族的功能验证奠定基础,并为后续筛选苎麻纤维发育候选基因提供依据.

关键词：Kinesin家族;苎麻;韧皮纤维;基因表达