基于高通量测序的土壤细菌组成、丰度及多样性分析
山西农业大学高粱研究所
- 摘 要：
- 研究盐碱地土壤微生物群落结构变化,细菌数量变化可以作为高粱耐盐材料筛选的标准之一,本研究将为高粱耐盐材料的选育及高粱耐盐性研究提供理论依据.试验采用Illumina Miseq高通量测序方法对盐碱地高粱根际菌群结构进行分析,选用10份不同的高粱亲本材料,采集盐碱地高粱根际土壤样品,研究结果表明:耐盐材料OTU数量较多,土壤微生物的群体数量的增加及其生长速率的增大可有效地促进土壤酶的活性,从而提高材料的生长速率;样品342、473的Chao1、ACE和Shannon指数均最高,Simpson指数最小,该材料的物种多样性最高;相反,盐敏材料68、622的Chao1、ACE和Shannon指数均最低,Simpson指数最大,多样性最低.研究结果表明耐盐材料根际土壤细菌具有较高的物种多样性,该指标可以作为耐盐材料筛选的评价指标.
关键词：高通量测序;高粱;盐碱地;土壤细菌组成、丰度;多样性分析
相似文章
-
广东潮土生物炭对不同水稻品种的土壤细菌群落的影响 [丁玮, 阳树英, 刘洋, 张亚宁, 张波] 华南农业大学学报 2022 (3) 42-49
-
DNA分子检测技术在节肢动物食物网结构解析中的应用 [杨帆, 刘冰, 陆宴辉] 植物保护学报 2022 (1) 110-117
-
体外消化前后EGCG对肠道菌群组成的影响 [李浩楠, 雷嗣超, 辜煊, 谢辰阳, 李杰, 杨芳, 张美] 中国果菜 2022,42 (3) 40-46,79
-
奶牛养殖发酵床不同深度菌群结构及其应用效果分析 [韩姗姗, 李忠玲, 张强, 岳淑宁] 畜牧与饲料科学 2021,42 (6) 39-45
-
荒漠草原不同发育阶段柠条灌丛堆土壤真菌群落多样性特征研究 [王子寅, 刘秉儒, 牟红霞, 李子豪] 干旱地区农业研究 2022,40 (3) 218-227
-
荒漠植物珍珠猪毛菜根际土壤细菌多样性与土壤理化性质相关性分析 [魏艳晨, 陈吉祥, 王永刚, 孟彤彤, 韩亚龙, 李美] 中国农业科技导报 2022,24 (5) 209-217
-
鼠茅草套种对不同林龄油茶根际土真菌群落的影响 [王晓艳] 福建农业科技 2022,53 (3) 32-39
-
爬行动物肠道微生物研究进展 [钟春英, 谭茵, 唐三淇, 刘亚婷, 武正军] 野生动物学报 2022,43 (1) 278-286
-
油茶地蜂不同龄期幼虫肠道细菌多样性及其差异分析 [寇若玫, 窦飞越, 李红英, 周泽扬, 龙金桂, 黄敦元] 环境昆虫学报 2022,44 (2) 402-413
-
胡椒浸泡脱皮过程中真菌菌群的动态变化 [李鑫, 王福清, 吴桂苹, 段梦雅, 陈文学, 谷风林] 热带农业科学 2022,42 (5) 67-74
