稻属AA染色体组8个种间SSR多样性与亲缘关系
山西农业大学生物工程中心;中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室
- 摘 要：
- 选用平均分布于水稻基因组的30对SSR引物,对AA染色体组8个野生稻种共42份材料的遗传多样性及遗传关系进行了研究。结果显示,本试验选取的30个SSR标记均具有多态性,多态性位点百分率为100%。30个多态性位点共扩增出的等位基因数为224,每个位点可扩增出3~10个等位基因,平均7.47个;等位基因有效数(Ae)变幅为1.25~8.91,平均5.45。多样性指数中,Shannon多样性指数(I)为0.454~2.386,平均1.826;而Nei基因多样性指数变幅为0.199~0.888,平均0.774。系统聚类和带型分析结果表明,亚洲栽培稻(Oryza sativa)与普通野生稻(O.rufipogon)的亲缘关系最近,非洲栽培稻(O.glaberrima)则与巴蒂野生稻(O.barthii)关系最为密切,杂草稻(O.spontanea)与普通野生稻(O.rufipogon)、亚洲栽培稻(O.sativa)之间有较近的亲缘关系,而展颖野生稻(O.glumaepatula)、长雄蕊野生稻(O.longis-taminata)与AA组其他稻种之间的亲缘关系较远。
关键词：稻属;AA染色体组;简单重复序列标记;多样性;亲缘关系
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