杧果PEPC基因家族全基因组鉴定及表达分析
海南省农垦科学院;海南大学园艺学院/热带作物新品种选育教育部工程研究中心
- 摘 要:
- PEPC家族蛋白在植物光合碳同化过程中具有重要作用,同时具有多种非光合生物学功能,目前杧果中鲜见报道。本研究对杧果MiPEPCs进行了全基因组鉴定,并分析了它们在不同组织(成熟叶片、成熟树皮、种子、根、花、果肉和果皮)和两个品种(高糖品种台农一号杧和低糖品种热农1号杧)中的表达情况。结果表明,杧果MiPEPC基因家族成员4个,其理化特征较为相似,且所有MiPEPCs蛋白亚细胞定位预测均为细胞质。基因组定位发现杧果MiPEPCs分布于4条不同的染色体。联合拟南芥,水稻,菠萝的PEPCs蛋白进行系统进化分析显示可分为2个亚组,MiPEPCs分布在第I(PTPC)和II亚族(BTPC)。杧果植物型MiPEPCs和细菌型MiPEPCs分离时间早于单子叶植物和双子叶植物的分离时间,两者蛋白序列差异大,但仍具有一定的保守性。顺式作用元件分析显示,MiPEPCs含有数量较多的光响应元件和激素响应元件。转录组表达分析结合qPCR试验验证发现,MiPEPCs在不同杧果组织中的表达具有偏好性,可能参与杧果的多个生物学过程(包含光合和非光合过程),初步推测MiPEPC1、MiPEPC3可能参与杧果果实成熟过程,为进一步探究MiPEPC家族在杧果中的生物学功能奠定了基础。
关键词:杧果;PEPC基因家族;果实发育;表达分析;蛋白序列;
相似文章
-
赤霉素生物合成抑制剂促进杧果成花的作用和对顶芽代谢谱的影响 [梁飞, 许文天, 武红霞, 郑斌, 梁清志, 王松标, 李映志] 果树学报 2022 (6) 957-969
-
杧果设施栽培品种筛选研究 [李日旺, 黄国弟, 陈永森, 唐莹莹, 覃昱茗, 罗世杏, 唐玉娟, 黄锦媛, 郭丽梅, 赵英] 中国南方果树 2022 (2) 64-66,71
-
百色杧果栽培种质果实品质多样性分析 [李曦, 王烨熔, 黄慧俐, 钟勇, 杨谨瑛, 蒋强, 陈千付] 热带作物学报 2022,43 (4) 714-721
-
杧果采后炭疽病生防菌株筛选及其培养特性研究 [张晓勇, 李树江, 严凯, 翁贵英, 张韵霞, 龙巧芳, 梁文, 蒋芹娜, 杨友联] 园艺学报 2021 (11) 2171-2184
-
杧果GeBP转录因子家族基因的鉴定及表达分析 [孙瑞青, 杨楠, 刘志鑫, 夏煜琪, 孙宇, 高庆远, 蒲金基, 党志国, 张贺] 经济林研究 2021 (4) 137-147
-
4种有机肥对桂热杧82号果实产量、品质和土壤性质的影响 [何堂熹, 罗聪, 刘源, 周立, 杨小州, 范志毅, 江唐鑫, 李峰, 方中斌, 何新华] 中国南方果树 2021 (6) 52-57,62
-
杧果成花过程碳水化合物和可溶性蛋白含量的变化 [高天瑜, 郑斌, 许文天, 梁清志, 王松标, 李蕊, 曾教科, 武红霞] 中国南方果树 2022,51 (3) 63-69
-
广西杧果传粉昆虫调查及诱蝇授粉试验研究 [江唐鑫, 何堂熹, 罗聪, 王小云, 何新华] 中国南方果树 2022 (2) 50-56
-
温度胁迫对"热农1号"杧果花粉萌发的影响 [刘馨语, 杜成勋, 资晶, 肖艺琳, 严晶, 李春宏, 陈东东, 王松标, 梁清志] 中国南方果树 2022,51 (3) 70-73,78
-
海南杧果产业发展及分析 [刘德兵, 刘国银, 魏军亚] 中国热带农业 2022 (2) 11-18