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鸡IFITM/IFIT基因家族中与抗禽流感病毒相关的关键基因挖掘

作  者:
张夕霏;张贝;周泽宇;孟婕;耿立英;张传生;李祥龙
单  位:
河北科技师范学院河北省特色动物种质资源挖掘与创新重点实验室
关键词:
鸡;IFITM/IFIT基因家族;加权基因共表达网络分析
摘  要:
为深入了解分析鸡IFITM/IFIT基因家族的特性,以禽流感病毒攻毒后的鸡RNA-seq数据为研究对象,通过加权基因共表达网络分析,构建了鸡的肺组织对不同亚型禽流感免疫反应的加权基因共表达网络,并对其模块进行了性状关联性分析与功能富集分析,进而筛选出鸡IFITM/IFIT基因家族中与抗禽流感病毒胁迫相关的枢纽基因。结果显示:鸡IFITM/IFIT基因家族成员中,IFITM2,IFITM3和IFIT5基因参与应答禽流感病毒诱发的免疫反应。其中,IFIT5基因属于H5N1病毒早期免疫应答模块的枢纽基因,在H5N1病毒诱发的早期免疫通路中发挥重要作用。

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