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主要禾本科作物ASR基因家族全基因组鉴定及表达分析

作  者:
孟亚轩;孙颖琦;赵心月;王凤霞;瓮巧云;刘颖慧
单  位:
河北北方学院农林科技学院
关键词:
禾本科作物;ASR基因家族;表达分析;系统进化;
摘  要:
对谷子、水稻、高粱、玉米、小麦等主要禾本科作物ASR(Abscisic acid-,stress-,ripening-induced protein)家族基因进行鉴定,并对其序列、系统进化、结构域、启动子及表达模式进行分析,为进一步研究ASR蛋白功能提供参考。结果表明,从谷子、水稻、高粱、玉米、小麦基因组中分别鉴定出7、6、8、9、29个ASR家族成员,不均匀分布在染色体上。ASR家族基因聚类为4个亚组,基因结构具有组内保守性和组间多样性。ASR蛋白具有保守的氨基酸基序,但Ⅱ-2亚组相较于其他亚组差异明显。ASR家族成员均只含有ABA/WDS结构域,位于C-末端。在进化过程中,ASR基因整体上正经历纯化选择。亚细胞定位预测结果表明,大部分ASR蛋白定位在细胞核,小部分定位在细胞质。启动子分析结果表明,ASR家族基因具有大量组织特异性元件、应激响应元件和激素响应元件。表达分析结果表明,ASR基因广泛响应非生物胁迫,其表达具有组织特异性,并且不同物种、不同基因间存在差异。

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