当前位置: 首页 > 文章 > 矩镰荚苜蓿与近缘种花苜蓿的DNA条形码筛选 草地学报 2023,31 (8) 2323-2333
Position: Home > Articles > Screening of DNA Barcodes for Medicago archiducis-nicolai and Its Relative Medicago ruthenica Acta Agrestia Sinica 2023,31 (8) 2323-2333

矩镰荚苜蓿与近缘种花苜蓿的DNA条形码筛选

作  者:
王霞;刘艳;贾秀秀;李永强;方强恩
单  位:
关键词:
矩镰荚苜蓿;物种界定;psbA-trnH;GA3ox1;DNA条形码
摘  要:
为了筛选适于鉴定易混淆种矩镰荚苜蓿(Medicago archiducis-nicolai)和花苜蓿(M.ruthenica)的DNA条形码,本研究采集了两近缘种的113个样本,对6个候选条形码序列(通用序列rbcL,psbA-trnH,trnL-trnF,trnK-matK,ITS2和新序列GA3ox1)进行PCR扩增、测序和序列比对,经过barcoding gap分析、wilcoxn检验以及构建NJ系统发育树评价各序列的鉴定能力.结果显示:6条候选序列的扩增和测序成功率在85%以上;rbcL序列在两近缘种间不存在变异位点,其余5条候选序列各有不同的种内变异和种间变异;5条候选序列的种间最小遗传距离均大于种内最大遗传距离,GA3ox1,ITS2和psbA-trnH序列在种内种间存在明显的"Barcoding Gap"区域;在候选序列构建的NJ系统进化树中,利用GA3ox1和psbA-trnH,矩镰荚苜蓿和花苜蓿均能各自形成单系,但trnL-trnF,trnK-matK和ITS2不能将两个近缘种区分开.通过分析,我们推荐使用核编码基因GA3ox1作为鉴定矩镰荚苜蓿和花苜蓿的首选序列,叶绿体基因psbA-trnH作为辅助条形码.
译  名:
Screening of DNA Barcodes for Medicago archiducis-nicolai and Its Relative Medicago ruthenica
关键词:
Medicago archiducis-nicolai%Species identification%psbA-trnH%GA3ox1%DNA barcoding

相似文章

计量
文章访问数: 7
HTML全文浏览量: 0
PDF下载量: 0

所属期刊

推荐期刊