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不同品种犬表皮生长因子基因的克隆与分子特征分析

作  者:
杨传定;魏建超;史子学;邵东华;王少辉;李蓓蓓;王雪敏;马志永
单  位:
河北工程大学农学院;中国农业科学院上海兽医研究所
关键词:
表皮生长因子;犬;基因克隆;序列分析
摘  要:
为分析和比较不同品种犬的表皮生长因子(canine epidermal growth factor,cEGF)基因的分子特征及其差异,收集11个常见不同品种犬的血样,提取基因组,采用PCR方法分别扩增出编码cEGF的N端和C端结构域的犬32号染色体20和21号外显子,纯化后与pMDTM18-T Vector连接构建重组子并转化大肠杆菌DH5α感受态,PCR鉴定阳性克隆后送样测序,用20和21号外显子序列拼接出cEGF全长,采用BLAST和DNAStar软件分析序列相互关系特征。结果:成功扩增出11种不同品种犬EGF编码基因,全长为156 bp,编码52个氨基酸,犬EGF基因序列同源性在97.4%~100%之间。根据cEGF编码基因推导氨基酸序列同源性为98.1%~100%,除了杜宾犬(Doberman Pinscher)EGF氨基酸在52位点处R→F,其余的氨基酸序列都一致。cEGF氨基酸序列与几种其他动物及人EGF相比较发现:cEGF与家猫EGF(Felis catus EGF)同源性很高,达到94.2%。表明不同品种犬的EGF编码基因有很高的同源性且非常保守,并与家猫EGF也有很高的同源性。

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