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当前位置: 首页 > 文章 > 太岁DNA提取方法差异及对测知细菌结构的影响 扬州大学学报(农业与生命科学版) 2021 (5) 123-129
Position: Home > Articles > 太岁DNA提取方法差异及对测知细菌结构的影响 Journal of Yangzhou University(Agricultural and Life Science Edition) 2021 (5) 123-129

太岁DNA提取方法差异及对测知细菌结构的影响

作  者：
王朝江;王世清;高春燕;李慧;李聪
单  位：
河北省农林科学院经济作物研究所
关键词：
太岁;DNA提取方法;细菌结构;高通量测序;
摘  要：
以太岁取样的加水热溶解为特点设计4种提取方法,将提取效果好的2个DNA样品用Illumina MiSeq高通量测序平台测序。结果表明:滤膜法（SI3）和研磨法均可获得显示电泳条带的DNA,但前者能将太岁材料彻底破碎和滤除多糖;滤膜法样品测得优质序列46 676条,聚类OTU 1 095个,比研磨法多154个,只包含1个序列相对丰度大于1%的共有OTU,特有1个序列相对丰度41.14%的OTU,是研磨法的237倍,但滤膜法样品香农指数反比研磨法低1.37%,并导致两者菌群结构在各分类水平上有着明显差别。太岁DNA提取方法深刻影响细菌结构测定结果,滤膜法DNA菌群信息更真实,据其测知的优势结构为假单胞菌属（Pseudomonas）和不动杆菌属（Acinetobacter）。

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