中国农业期刊集成服务平台

当前位置: 首页 > 文章 > 化州柚SCoT-PCR反应体系的优化及分类鉴别研究江苏农业科学 2018 (11) 34-39

Position: Home > Articles > Study on classification and identification of Citrus maxima cv. tomentosa and orthogonal optimization of its SCoT-PCR reaction system Jiangsu Agricultural Sciences 2018 (11) 34-39

化州柚SCoT-PCR反应体系的优化及分类鉴别研究

作者：

王浩涵;杨洁清;欧阳小健;孙杨杨;黄海波

单位：

广州中医药大学

关键词：

化州柚;化橘红;SCoT;遗传多样性;分类鉴别

摘要：

用目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism,简称SCoT)分子标记对化州柚及其近缘种进行鉴别研究。为构建适合化州柚的SCoT-PCR最佳反应体系,对PCR体系的5大要素采用L_(25)(5~6)表设计正交试验,得到最佳20μL反应体系:3 mmol/L Mg~(2+)、0.25 mmol/L d NTPs、0.75 U Taq酶、0.4μmol/L引物、50 ng DNA。从36条引物中筛选出6条多态性明显的引物并优化其退火温度。最后用优化的6条引物对25份样品进行扩增,共扩增出94条条带,其中多态性条带69条,多态性比例范围55.56%~85.00%,平均多态性73.4%。构建的非加权配对算术平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,简称UPGMA)聚类树能够较好地区分化州柚与其他柚类,且不同品种的化州柚间也存在一定的差异。因此在化州柚的分类鉴别研究中,SCoT标记不失为一种便捷、有效的手段。

译名：

Study on classification and identification of Citrus maxima cv. tomentosa and orthogonal optimization of its SCoT-PCR reaction system

作者：

Wang Haohan;

相似文章

止咳化痰化橘红 [魏浩] 农村百事通 2021 (4) 59
化州柚种质资源的SSR分析及其果实不同发育期柚皮苷含量变化 [田静, 庞一波, 陈嘉景, 袁子彧, 曾继吾, 徐娟] 华中农业大学学报 2019 (5) 64-70
中药“化橘红”原料植物化州柚种质资源初步研究 [李润唐, 李映志, 汪永保, 余庆, 李映晖] 中国南方果树 2012,41 (4) 57-59
基于代谢组学分析不同品系化州柚花间差异代谢物 [陈婉冰, 毛根林, 钟玉娟, 曾继吾] 果树学报 2024,41 (10) 1990-2001
化州柚的矿质营养元素累积和分配特性研究 [陈乾平, 唐春风, 廖苏奇, 陈路, 冯世鑫, 彭玉德] 热带农业科学 2024,44 (7) 47-52

导出引用

计量

文章访问数: 8

HTML全文浏览量: 0

PDF下载量: 0

化州柚SCoT-PCR反应体系的优化及分类鉴别研究

相似文章

所属期刊

江苏农业科学

推荐期刊

华中农业大学学报

热带农业科学