当前位置: 首页 > 文章 > 甘蔗MAP激酶基因SoMAPK克隆与生物信息学分析 南方农业学报 2012,43 (6) 727-732
Position: Home > Articles > Cloning and bioinformatic analysis of Mitogen-activated protein  kinase gene SoMAPK4 in sugarcane Journal of Southern Agriculture 2012,43 (6) 727-732

甘蔗MAP激酶基因SoMAPK克隆与生物信息学分析

作  者:
李粲;滕峥;刘开雨;桑洪玉;卢双楠;方位宽;梁朝旭;刘晓静;何姗珊;刘芳;邱永福;李鸣;李容柏
单  位:
广西大学农学院
关键词:
甘蔗;MAP;基因克隆;soMPK4;生物信息学;sugarcane; MAP; gene cloning; SoMAPK4; bioinformatics
摘  要:
[目的]克隆甘蔗MAP激酶家族新基因的全长序列,为了解甘蔗抗逆胁迫机制提供依据.[方法]以新台糖22为材料,提取甘蔗幼叶总RNA并反转录为cDNA;利用已知物种MAP激酶基因核苷酸序列保守区设计引物,采用5'和3'端RACE技术克隆新基因全长,并进行生物信息学分析.[结果]克隆获得的甘蔗新基因与玉米ZmMAPK4同源性很高,达92.6%,将该基因命名为soMAPK4(登录号JQ062930),基因全长1499bp,其中开放阅读框(0RF)为1128bP,5'非翻译区(UTR)为218bp,3'非翻译区(UTR)为213bp.生物信息学分析结果表明,S0MPK4基因编码一个含376个氨基酸的蛋白质,分子量约43.5kDa,等电点为5.51,含有11个保守的蛋白激酶亚区和MAP激酶的磷酸化位点TEY基序.[结论]克隆获得甘蔗MAP激酶新基因soMA雕4,该基因可能参与多种胁迫反应的信号传递,是研究甘蔗非生物胁迫和生物胁迫过程中信号传递的一个关键因素.
译  名:
Cloning and bioinformatic analysis of Mitogen-activated protein  kinase gene SoMAPK4 in sugarcane

相似文章

计量
文章访问数: 13
HTML全文浏览量: 0
PDF下载量: 0

所属期刊

推荐期刊