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Position: Home > Articles > Complete Sequence Analysis of Cucumber mosaic virus CTL Isolate Acta Horticulturae Sinica 2008,35 (2) 213-220

侵染白菜的黄瓜花叶病毒分离物基因组的全序列分析

作  者：
曾蓉;陈燕飞;严师节;黎定军;陈集双
单  位：
湖南农业大学生物安全科技学院;浙江理工大学生物工程研究所
关键词：
黄瓜花叶病毒;白菜;基因组序列;系统进化树分析
摘  要：
对浙江省杭州地区白菜(Brassica campestris L.ssp.chinensis var.commuis Tsenet Lee.)上获得的CMV分离物(CMV-CTL)进行了全长克隆和基因组序列分析。结果显示:CMV-CTL的RNA1(Gen-Bank序列号:EF213023)全长为3357个核苷酸(nt),编码993个氨基酸(aa)的1a蛋白;RNA2(Gen-Bank序列号:EF213024)全长为3047nt,编码858aa的2a蛋白和111aa的2b蛋白;RNA3(GenBank序列号:EF213025)全长为2217nt,编码278aa的MP蛋白和218aa的CP蛋白。序列相似性分析表明,CMV-CTL与CMV亚组B中株系IA相似性最高,RNA1、RNA2和RNA3与该株系的相似性分别为91·3%、91·3%和93·6%。CP基因和RNA3的5′NTR核酸序列系统发生树分析表明,CMV-CTL与中国大多数CMV分离物一样,属于CMV亚组IB。
译  名：
Complete Sequence Analysis of Cucumber mosaic virus CTL Isolate
作  者：
ZENG Rong1,2,CHEN Yan-fei1,YAN Shi-jie1,LI Ding-jun2,and CHEN Ji-shuang1(1Institute of Bioengineering,Zhejiang Sci-Tech University,Hangzhou 310018,China;2College of Bio-Safety Technology,Hunan Agricultural University,Changsha 410128,China)
关键词：
Cucumber mosaic virus;Brassica campestris L.ssp.chinensis var.commuis Tsen et Lee.;genomic sequence;phylogenetic tree analysis
摘  要：
Isolate CMV-CTL was obtained from Brassica campestris L.ssp.chinensis var.commuis Tsen et Lee.,in Hangzhou,Zhejiang Province.The full-length cDNA sequence of genomic RNAs of the isolate was determined by RT-PCR and sequencing.The results showed that CMV-CTL RNA1(GenBank accession No.EF213023) consists of 3 357 nucleotides(nt),encoding 1a protein of 993 amino acids residues(aa).RNA2(GenBank accession No.EF213024) consists of 3 047 nt,encoding 2a protein of 858 aa and 2b protein of 111 aa.RNA3(GenBank accession No.EF213025) contains of 2 217 nt,encoding 3a protein of 278 aa and CP of 218 aa.CMV-CTL showed the highest sequence identities with strain IA which belongs to CMV subgroup IB.The sequence identities of RNA1,RNA2 and RNA3 between CTL and IA strains were 91.3%,91.3% and 93.6%,respectively.Phylogenetic analysis of CP and 5'NTR of RNA3 suggested that CMV-CTL belongs to CMV subgroup IB.

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