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马岗鹅早期发育阶段腿肌lncRNA-miRNA-mRNA网络构建与分析

作  者:
洪龙胜;许丹宁;李婉雁;曹楠;付新亮;田允波;李玉谷;李冰心
单  位:
仲恺农业工程学院动物科技学院;华南农业大学兽医学院
关键词:
马岗鹅;全转录组分析;ceRNA;腿肌
摘  要:
为探究非编码RNA对鹅骨骼肌生长发育的调控机制,试验以20胚龄和孵化后3日龄马岗鹅的腿部肌肉作为研究对象,通过HE染色观察不同阶段腿肌组织结构差异,并通过RNA测序探讨可能影响腿肌生长发育的RNAs。3日龄马岗鹅腿肌相较于20胚龄显示出了完整的肌纤维结构,肌纤维轮廓清晰;两阶段内共有2 289个差异表达mRNAs,17个差异表达miRNAs和192个差异表达lncRNAs;差异表达基因在骨骼肌生长和发育相关的通路中显著富集,如细胞周期、FoxO信号通路和MAPK通路等;研究通过预测差异表达的mRNA和lncRNA与miRNA的靶向关系,成功构建一个与骨骼肌生长发育密切相关的ceRNA网络,其中36个lncRNAs、10个miRNAs被预测可以调控CCNB2、SHC4、ANGPT2、NRK、SLC25A4、WHAMM、FREM1、HMMR、PHKG1、DUSP1和COL1A2等与腿肌生长发育相关的基因。研究结果揭示了lncRNA和miRNA在鹅腿肌生长和发育中的潜在功能和机制,为进一步的研究提供了参考。

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