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当前位置: 首页 > 文章 > 基于SLAF-seq的茶组子房室数不稳定居群种质亲缘关系分析 园艺学报 2022,49 (11) 2455-2470
Position: Home > Articles > Genetic Relationship Analysis of the Population Germplasms of Section Thea with Unstable Ovary Locule Number Based on SLAF-seq Acta Horticulturae Sinica 2022,49 (11) 2455-2470

基于SLAF-seq的茶组子房室数不稳定居群种质亲缘关系分析

作  者：
吴致君;李伟;王兴华;张成;蒋勋;黎盛;罗理勇;孙康;曾亮
单  位：
关键词：
茶组;子房室数;亲缘关系;SLAF-seq;SNP
摘  要：
为了进一步探究子房室数不稳定(子房无毛、3~5室、花柱3~5裂)茶组(section Thea)居群种质(UONG)的亲缘关系,明确居群内个体的变异是否引起了种间变异,以重庆、云南及其他部分省份87个山茶属茶组和非茶组植物(外类群对照)种质为材料,利用SLAF-seq技术进行简化基因组测序和分子标记分析.测序共获得2 804 071个SALF标签,平均测序深度为11.73×.通过SALF标签比对参考基因组,共获得25 069 219个群体SNP分子标记.基于高一致性SNP数据,系统发育树、遗传结构和PCA分析等方法均将调查种质分为3种类型,即云南等的茶组和非茶组种质(Ⅰ类)、重庆大茶树居群种质(Ⅱ类)和多个省份来源的茶系(常见栽培种和'川小种')种质(Ⅲ类).Ⅰ类种质中茶组植物,包含了五室茶系、五柱茶系、秃房茶系和茶系种质.Ⅱ类种质由UONG和茶系种质(形态特征介于UONG与常见茶系种质之间)组成.此外,遗传分化系数FsT表明,Ⅱ类种质与其他几类种质遗传分化程度最高(>0.3),Ⅰ类与Ⅲ类种质之间也存在较高的遗传分化(>0.2).简化基因组测序分类结果和FsT值表明,调查的UONG为一类相对独立种质,居群内个体的变异并未引起种间变异.因此,将该类种质归入到一个种下的处理较为合理.此外,在重庆地区存在一类与UONG遗传结构交叉的茶系种质,可能为自然远缘杂交后代.
译  名：
Genetic Relationship Analysis of the Population Germplasms of Section Thea with Unstable Ovary Locule Number Based on SLAF-seq

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