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延边黄牛lncRNA MEG3基因多态性及其与生长性状的关联分析

作  者:
田佺;赵祎;王卓;刘磊;张君正;戢爽
单  位:
延边大学农学院
关键词:
延边黄牛;lncRNA;MEG3基因;SNP;生长性状;
摘  要:
试验旨在研究长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)MEG3(maternally expressed gene 3)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)及其与延边黄牛生长性状之间的关联性。通过DNA直接测序法和高分辨率熔解曲线技术(high resolution melting curve, HRM)分析了90头24月龄延边黄牛MEG3基因多态性,并结合胸宽、髋宽和腹围等13项生长性状进行关联分析。结果显示,MEG3基因第5外显子包含g.65745819 G>A和g.65745850 C>A 2处突变,均存在2个等位基因,分别为G、A和C、A,等位基因频率分别为0.661、0.339和0.778、0.222,产生3个基因型,分别为GG、GA、AA和CC、CA、AA,基因型频率分别为0.422、0.478、0.100和0.611、0.333、0.056;卡方适应性检验发现,2个位点均未偏离哈迪-温伯格平衡(P>0.05)。2个位点遗传纯合度、杂合度、有效等位基因数和多态信息含量(PIC)分别为0.552、0.448、1.812、0.348和0.286、0.346、1.528、0.286,均处于中度多态(0.25A位点GA基因型胸宽显著高于AA基因型(P<0.05),AA基因型髋宽显著高于GG和GA基因型(P<0.05);g.65745850 C>A位点AA基因型腹围显著高于CA基因型(P<0.05),其余基因型各指标之间差异均不显著(P>0.05)。结果表明,lncRNA MEG3基因多态性与延边黄牛部分生长性状相关,可作为延边黄牛分子标记辅助育种的候选基因。

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