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不同季节新鲜鸭蛋表面污染细菌的多样性分析

作者：

卢昌丽;熊香元;龚慧可;任佑华;陈力力;刘焱

单位：

湖南农业大学食品科学技术学院食品科学与生物技术湖南省重点实验室

关键词：

鸭蛋壳;季节性;高通量测序;细菌多样性

摘要：

为研究鸭蛋壳表面污染细菌的多样性以及季节性变化,在春、夏、秋和冬4个季节采集新鲜鸭蛋,利用超声波洗涤蛋壳制备细菌样本,通过Illumina MiSeq高通量测序分析样品细菌菌群的多样性.结果表明,共获得697244条优化序列归属于650个操作分类单元(operational taxonomic units,OTU),包括35个门,298个属,447个种.其中相对丰度占比较大的优势菌有:厚壁菌门(Firmicutes)芽孢杆菌属(Bacillus)和肠球菌属(Enterococcus),分别占比17.78%和17.16%;变形菌门(Proteobacteria)肠杆菌科(Enterobacteriaceae)埃希氏菌属-志贺菌属(Escherichia-Shigella)占比17.14%.4个季节样品的优势菌群相同,皆为芽孢杆菌属(Bacillus)、肠球菌属(Enterococcus)和埃希氏菌属-志贺菌属(Escherichia-Shigella),但种群结构和物种丰度各不相同,冬季样本Chao指数和ACE指数最大,平均分别为596.5±22.29和587.5±17.82;Shannon指数最大和Simpson指数最小,平均分别为3.52±1.02和0.1±0.07,种群复杂度表现最为突出;春夏秋冬四季样品共有的OTU为35个,分别占各样品OTU数目的0.06%~70.00%,独有的OTU数目分别为9(春)、0(夏)、17个(秋)和496个(冬),各个季节样品的菌群种类具有较大的差异性;不同季节分别有弧菌(Vibrio)、淤泥假单胞菌(Pseudomonas_caeni)、肠杆菌(Enterobacter)、溶菌杆菌(Lysinibacillus)、梭菌(Clostridium_sensu_stricto_1)等存在,部分致病菌受气温影响明显.该结果为进一步研究鸭蛋主要腐败菌及其控制提供了理论依据.

译名：

Diversity and Seasonal Variation of Bacteria Contaminating Fresh Duck Egg Surface

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