中国农业期刊集成服务平台

当前位置: 首页 > 文章 > 基于全基因组重测序的罗坑鸡遗传结构分析及特征位点挖掘中国畜牧杂志 2024,60 (10) 100-105

Position: Home > Articles > 基于全基因组重测序的罗坑鸡遗传结构分析及特征位点挖掘 Chinese Journal of Animal Science 2024,60 (10) 100-105

基于全基因组重测序的罗坑鸡遗传结构分析及特征位点挖掘

作者：

严霞;莫玙;孔少芬;罗威;王春兰;陈细浩;钟澜;罗成龙;蔡柏林;聂庆华

单位：

韶关市畜牧研究所;猪禽种业全国重点实验室;广东省农业科学院动物科学研究所

关键词：

罗坑鸡;全基因组重测序;系统进化树;主成分分析;血缘成分分析;群体分化指数

摘要：

本文旨在研究新资源罗坑鸡与其他著名广东地方品种鸡的遗传关系和挖掘罗坑鸡的特征性位点.对20个罗坑鸡血样进行DNA提取和30×全基因组重测序.同时,将这些数据与本课题组已有的5个广东鸡种(共77 只)样本的数据相结合,采用系统进化树、主成分分析和祖先血缘成分分析等方法分析群体结构,采用群体分化指数分析方法挖掘罗坑鸡的特征位点.结果表明:系统进化树显示所有罗坑鸡在进化上明显聚为一类,与其他广东鸡种有明显分群;主成分分析发现罗坑鸡的遗传成分与其他广东鸡种有明显区分,但群体内的均一性较差;祖先血缘成分分析揭示罗坑鸡存在血缘混杂现象,纯血个体占比较少;群体分化指数分析发现罗坑鸡具有特异性的分化位点,可用于品种鉴定和提纯.本研究结果表明,罗坑鸡与其他 5 个品种在核基因组水平上有明显差异;存在血缘混杂现象;有独特的特异性位点.本研究结果将填补目前对于罗坑鸡研究的空白,并为未来罗坑鸡种质资源创新利用做了理论支撑.

相似文章

韶关市罗坑鸡种质资源调查及现状分析 [谢光明, 陈细浩, 李海忠, 钟澜, 黎永锋, 王春兰, 刘科, 陈锡朗, 林发通, 陈世亮, 黄文辉, 詹惠娜, 聂庆华] 养禽与禽病防治 2024 (1) 6-8
隐性白羽和矮小基因分子标记辅助技术在新资源罗坑鸡的应用 [严霞, 王春兰, 李静, 许欣纯, 陈伟森, 何燕华, 陈细浩] 广东畜牧兽医科技 2025,50 (2) 66-70

导出引用

计量

文章访问数: 13

HTML全文浏览量: 0

PDF下载量: 0

基于全基因组重测序的罗坑鸡遗传结构分析及特征位点挖掘

相似文章

所属期刊

中国畜牧杂志

推荐期刊

养禽与禽病防治

广东畜牧兽医科技