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3个绵羊群体UCP1基因的遗传结构和功能预测分析

作  者:
邹诗凡;张天闻;邵顺成;梁鹏;张稳;刘罗兰;冯登侦
单  位:
宁夏大学农学院
关键词:
绵羊;UCP1;遗传结构;生物信息学;
摘  要:
为探究绵羊UCP1基因在3个绵羊品种中的遗传结构与多态性,以滩羊、杜泊羊、小尾寒羊作为研究对象,通过靶向测序检测了91只绵羊的UCP1基因全序列的SNPs和Indel,所得测序结果与绵羊参考基因组(Oarrambouilletv1.0)进行比对分析,并利用卡方独立性检验判断各位点群体间的差异显著性,对其中差异显著位点进行基因组型分类,并利用相关生物信息学软件预测分析相关位点突变后对其mRNA二级结构的影响,同时对各基因组型进行蛋白质特性分析。结果表明,在UCP1基因外显子区域筛选到2个群体间差异显著的错义突变位点(18692223G>A,18693167G>A)以及3种基因组型;生物信息学分析发现,单个位点突变均使得m RNA二级结构最小自由能升高,引起UCP1基因mRNA二级结构稳定性降低,但变化不太明显;蛋白质结构预测单倍型中α螺旋比例降低,无规则曲卷比例升高,其稳定性降低,且以基因组型A最为显著;根据信号肽分析,UCP1蛋白不存在跨膜运输,突变后也未发生改变,其蛋白质结构域也未发生改变。说明UCP1基因外显子区域的18692223位点和18693167位点在绵羊育种中具有一定的参考价值,今后可以考虑将这两个位点作为肉羊生长发育和脂肪沉积量选择的分子标记进行下一步的研究。

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