当前位置: 首页 > 文章 > 不同种源蒙古栎遗传变异 东北林业大学学报 2022,50 (4) 8-14,26
Position: Home > Articles > Genetic Variation of Quercus mongolica from Different Provenances Journal of Northeast Forestry University 2022,50 (4) 8-14,26

不同种源蒙古栎遗传变异

作  者:
李波;张伟溪;丁密;余金金;丁昌俊;黄秦军
单  位:
国家林业和草原局林木培育重点实验室(中国林业科学研究院林业研究所)
关键词:
蒙古栎;EST-SSR;遗传多样性
摘  要:
分析蒙古栎EST序列和叶绿体全基因组SSR位点信息,开发SSR引物,对蒙古栎群体遗传变异进行分析,为蒙古栎分子标记辅助育种奠定基础.利用est-trimmer、CAP3对蒙古栎EST序列处理,通过perl结合MI-SA、Primer3和Electronic PCR查找SSR位点,设计引物并筛选验证.EST序列中发现SSR位点163个,主要重复类型为二核苷酸.叶绿体基因组上88个SSR位点以单核苷酸重复为主.7对引物共检测到37对等位基因,平均等位基因数(Na)=5.286,Shannon's信息指数(I)=1.291,期望杂合度(He)=0.622,多态性信息含量(PIC)=0.692;群体间遗传分化系数(Fst)=0.147,基因流(Nm)=1.933;AMOVA分析表明,种源间遗传变异占10.216%.蒙古栎种源群体间存在中等水平的遗传分化,其遗传变异主要来源于种源内,且种源间的遗传变异与地理距离无显著相关性.基于EST序列及叶绿体基因组SSR位点信息,有效开发SSR引物,为蒙古栎遗传多样性研究提供更多的标记支持.
译  名:
Genetic Variation of Quercus mongolica from Different Provenances

相似文章

计量
文章访问数: 63
HTML全文浏览量: 0
PDF下载量: 0

所属期刊

推荐期刊