水稻分蘖期叶片淀粉和蔗糖代谢途径的转录组动态分析
东北农业大学农学院
- 摘 要:
- 为了探索水稻分蘖期叶片中生育进程相关代谢途径的转录响应情况,分别在分蘖期7 d、14 d和21 d收获水稻品种‘五优稻4号’(‘WYD4’)叶片,并进行动态转录组分析.结果表明,在水稻分蘖期共有 12 815个差异表达基因,通过 GO分析显示这些基因主要集中在细胞组分方面,KEGG分析表明淀粉与蔗糖代谢途径在整个分蘖期生育进程内有差异表达基因(DEGs)显著富集,并有 6 个淀粉与蔗糖代谢途径相关的差异表达基因在整个分蘖期显著差异表达.同时,预测的转录因子 SSⅠ(LOC_Os06g06560)在分蘖前期差异表达倍数达到 9.7 倍,并与 64个预测的蛋白互作.这表明淀粉与蔗糖途径关键基因在不同时间点的应答是有差异的,为水稻分蘖形成和群体构建提供了时间上的能量来源,也为水稻栽培精确调控提供了转录组学指导.
关键词:水稻;分蘖期;淀粉;可溶性淀粉合酶Ⅰ;转录组
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