中国农业期刊集成服务平台

当前位置: 首页 > 文章 > 繁殖基因(ESR、LH、LHR、PRLR)编码区生物信息学分析河南农业科学 2013,42 (1) 120-123

Position: Home > Articles > Bioinformatics Analysis of the Coding Regions of ESR,LH,LHR and PRLR Genes Journal of Henan Agricultural Sciences 2013,42 (1) 120-123

繁殖基因(ESR、LH、LHR、PRLR)编码区生物信息学分析

作者：

张宇;李祥龙;周荣燕;李兰会;王志刚

单位：

河北农业大学动物科技学院

关键词：

ESR;LH;LHR;PRLR;生物信息学

摘要：

为了研究各物种ESR、LH、LHR、PRLR基因进化的特点,从GenBank下载了人、毛猩猩、黑猩猩、猕猴、欧洲兔、野猪、黄牛、大熊猫、小家鼠、仓鼠、褐家鼠11个物种的139条编码区序列(CDS),采用生物信息学方法对4种基因进行分析。结果表明,4种基因均存在较丰富的遗传多样性。其中ESR基因单位长度多态位点数为0.330 7,单位长度突变位点数为0.399 8,核苷酸多样性最低,同义替换率相对最高,平均遗传距离最小。LH基因单位长度多态位点数(0.484 8)与单位长度总突变位点(0.618 3)均最高,核苷酸多样性和非同义替换率相对最高。依据4种基因遗传距离构建的聚类图的拓扑结构存在差异,说明4种繁殖基因进化速率存在差异,ESR基因进化速率相对较慢,LH基因相对较快。

译名：

Bioinformatics Analysis of the Coding Regions of ESR,LH,LHR and PRLR Genes

作者：

ZHANG Yu,LI Xiang-long,ZHOU Rong-yan,LI Lan-hui,WANG Zhi-gang(College of Animal Science and Technology,Agricultural University of Hebei,Baoding 071000,China)

关键词：

ESR;LH;LHR;PRLR;bioinformatics

摘要：

In order to study the different evolutional characters of ESR,LH,LHR and PRLR genes,139 sequences of the coding regions(CDS) from Homo sapiens,Pongo abelii,Pan troglodytes,Macaca mulatta,Oryctolagus cuniculus,Sus scrofa,Bos taurus,Ailuropoda melanoleuca,Mus musculus,Cricetulus griseus and Rattus norvegicus were downloaded from GenBank database and analyzed using bioinformatics methods.The result showed that there was rich genetic diversity of the 4 genes.The number of unit length polymorphic sites of ESR was 0.330 7 and the total number of mutation per base pair was 0.399 8.The ESR gene has lower genetic diversity and average genetic distance,but higher rate of synonymous substitution.While for the LH gene,it had richer genetic diversity and higher rate of non-synonymous substitution.So,it could be inferred that ESR may be more conservative and LH has higher evolutionary rate.

相似文章

应用4个繁殖性状候选基因对太湖猪群体遗传结构分析 [谢飞, 吴晗, 滕尚辉, 宋成义, 高波, 陈国宏] 畜牧与兽医 2008,40 (6) 23-26
苏姜猪ESR基因和FSHβ基因的多态性与繁殖性能的相关性研究 [孙丽亚, 王宵燕, 宋成义, 赵芹, 谢飞, 吴晗, 李碧春] 安徽农业科学 2008,36 (13) 5457-5458
腐植酸对阿特拉津的吸附特性研究 [常春英, 吕贻忠] 腐植酸 2011 (2) 11-15
巴克夏猪、霍寿黑猪及其杂交后代ESR基因和FSHβ基因多态性的检测 [许金根, 靳二辉, 顾有方, 王重龙, 李庆岗] 中国畜牧杂志 2021 (5) 87-91
6种小型浆果营养成分及DPPH自由基清除活性比较 [唐晓姝, 胡博, 陈雪梅, 张白曦] 江苏农业科学 2021 (20) 182-187
越冬针叶有机自由基产额对低温和光照的反应 [陶大立, 靳月华, 杜英君, 刘雅言, 刘桂珍, 詹瑞云] 应用生态学报 1992,3 (2) 120-124
越冬针叶的有机自由基及自由基清除剂 [陶大立, 靳月华, 高均成] 林业科学 1992,28 (3) 194-197
ESR基因多态性对不同胎次的大白猪母猪产活仔数的影响 [刘远, 张晓佩, 高承芳, 林仕欣, 林碧芬, 雷明刚, 李文献] 中国畜牧兽医 2011,38 (3) 160-162
梅山和大约克猪ESR和FSH-β基因多态性比较 [赵西彪, 于钦秀, 倪小军, 李拥军, 丁家桐] 中国畜牧兽医 2008,35 (5) 42-44
ESR、FSHβ、AHR基因多态性对二花脸猪产仔数的影响 [张倩, 方宇瑜, 李平华, 马翔, 蒋能静, 黄媛, 陆志强, 季铮渝, 黄瑞华] 南京农业大学学报 2019 (6) 1150-1157

导出引用

计量

文章访问数: 17

HTML全文浏览量: 0

PDF下载量: 0

繁殖基因(ESR、LH、LHR、PRLR)编码区生物信息学分析

相似文章

所属期刊

河南农业科学

推荐期刊

养猪

中国畜牧杂志