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太行鸡MC1R基因的克隆测序、表达及生物信息学分析

作  者:
范业锴;王鹏;周祖阳;韩海银;刘玉芳
单  位:
河北工程大学生命科学与食品工程学院
关键词:
太行鸡;MC1R基因;表达分析;生物信息学;羽色;
摘  要:
为研究影响太行鸡不同羽色性状的重要候选基因MC1R的表达及生物信息学特性,试验以太行鸡麻、白两种羽色为研究对象,采用PCR克隆、实时荧光定量PCR技术和生物信息学分析进行探讨。测序结果显示:太行鸡MC1R基因CDS序列为945 bp,编码蛋白为314个氨基酸;蛋白理化性质分析发现,MC1R蛋白存在7个跨膜区,为跨膜受体;CDS区序列比对发现,太行鸡MC1R基因存在c.637C>T的突变,突变造成编码氨基酸mRNA二级结构和编码蛋白空间结构发生改变;实时荧光定量PCR检测发现,太行鸡麻羽品系毛囊中MC1R的表达量极显著高于白羽品系(P<0.01)。研究结果表明:MC1R基因的c.637C>T突变显著影响太行鸡的羽色,可以作为太行鸡羽色选育的候选分子标记。

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