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基于转录组测序的小麦旗叶表皮蜡质差异表达基因分析

作  者:
温宏伟;党一飞;董凡凡;陈楠;张明义;武棒棒;逯腊虎;杨斌
单  位:
山西省临汾市农业技术推广站;山西农业大学小麦研究所
关键词:
小麦;蜡质突变体;RNA-Seq;表皮蜡质;
摘  要:
为探索小麦表皮蜡质合成机制及调控机制,研究以济麦22无蜡突变体和多蜡突变体抽穗期叶片为材料,采用转录组测序技术分析2种突变体中叶片基因表达情况,以筛选出差异表达基因,并对差异表达基因进行KEGG蜡质功能注释和通路富集分析。结果显示,在2种突变体叶片中共获得40.63 Gb高质量基因数据,各样品中有效数据均达到9.63 Gb,Q30碱基百分比在94.22%以上,比对效率达到91%以上。2种突变体叶片中共检测到6 840个差异表达基因,包括3 181个上调基因和3 659个下调基因。KEGG蜡质功能注释发现,差异基因主要富集到角质、亚角质和生物蜡的合成过程、脂肪酸降解以及过氧化物酶体生理活动过程,其中,与蜡质功能相关差异显著表达基因26个,主要包括CER1、MAH1、FAR和WSD1,这些基因通过调控醛、烷烃、伯醇、仲醇、酮及蜡酯合成过程,进而影响小麦表皮蜡质的差异表现。

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