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Position: Home > Articles > The Cassava GH3 Gene Family Identification and Expression Analysis in Response to Pathogen Infection Molecular Plant Breeding 2022,20 (6) 1755-1765

木薯GH3基因家族鉴定及其应答病原菌侵染的表达分析

作  者:
冯亚亭;李均一;唐丽;牛晓磊;陈银华;骆凯
单  位:
海南大学
关键词:
木薯;GH3;基因家族;表达分析;系统进化;生长素响应
摘  要:
Gretchenhagen3(GH3)属于植物生长素早期响应基因,通过控制生长素的稳态对植物生长发育和逆境胁迫响应起到了至关重要的作用,但是到目前为止仍未见对木薯GH3基因家族的研究报道.本研究通过生物信息学方法,在木薯全基因组数据中鉴定获得12个木薯GH3家族基因(MeGH3.1~MeGH3.12),其氨基酸分子量为44.53~69.92 kD,等电点范围为5.18~6.73,木薯所有GH3家族均含有motif 1、motif2、motif 3、motif4、motif 8和motif 10保守基序,具有3~4个外显子;根据系统进化关系可将MeGH3家族成员分为3组;木薯MeGH3基因不均匀分布在7条染色体上;启动子分析结果表明,MeGH3基因含有多种激素和胁迫响应顺式作用元件;表达分析发现,MeGH3基因在不同组织中表达量明显差异,绝大多数MeGH3基因受病原菌侵染诱导表达.综合考虑,MeGH3.4和MeGH3.5可作为研究木薯抗病机制的候选基因.
译  名:
The Cassava GH3 Gene Family Identification and Expression Analysis in Response to Pathogen Infection

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