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Special Wild Economic Animal and Plant Research
2022
(2)
25-30
'申鸿七彩雉鸡'mtDNA全基因组序列测序和系统发育关系分析
作 者：
陈芳;覃健峰;郑德滨;袁红艳;吴琼
单 位：
龙岩学院生命科学学院;上海欣灏珍禽育种有限公司
关键词：
‘申鸿七彩雉鸡’;线粒体全基因组;系统发育关系;
摘 要：
为了从分子角度解析‘申鸿七彩雉鸡’种群遗传背景,本研究采用PCR测序方法,对3个个体申‘鸿七彩雉鸡’的线粒体全基因组进行测序,并与NCBI公布的7条雉鸡线粒体基因组序列比对,构建系统进化树。获得‘申鸿七彩雉鸡’线粒体全基因组序列全长为16 685 bp,结构为典型的环状双链,包括13个蛋白质编码基因、2个rRNA、22个tRNA和D-Loop区。蛋白编码基因总长度为11 369 bp,基因重叠有7处,间隔有20处;D-loop序列长为1 148 bp,占整个基因的6.88%;tRNA基因长度为65～78 nt。’申鸿七彩雉鸡’线粒体全基因组、蛋白质编码基因、tRNA、rRNA和D-Loop区碱基组成中AT含量均大于CG含量。构建的进化树发现,’申鸿七彩雉鸡’和‘甘肃亚种雉鸡’聚为一类。
