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黑果枸杞SPL转录因子家族成员鉴定与生物信息学分析

作  者:
刘筠;郭毅;李效雄;胡晓桐;马瑞;杜雨;贾西贝;柳迪;马彦军
单  位:
甘肃林业职业技术学院;兰州资源环境职业技术大学;甘肃农业大学林学院
关键词:
黑果枸杞;NaCl胁迫;SPL转录因子;生物信息学分析
摘  要:
SPL(SQUAMOSA promoter-binding protein-like)家族成员参与植物的生长发育和胁迫响应,为探究黑果枸杞SPL家族基因在盐胁迫下的耐盐分子机制,本研究对其基因家族成员进行了鉴定和生物信息学分析。结果表明,从黑果枸杞转录组数据中共筛选出20个SPL基因家族成员,分为8个亚家族,蛋白质亚细胞定位预测结果显示SPL蛋白主要定位于细胞核,20个SPL蛋白均具有SBP保守结构域。黑果枸杞SPL家族蛋白质相对分子量为15 296.08~130 310.8;等电点为5.64~9.65;总原子数为2 106~18 214;氨基酸数量为133~1 176 aa;脂溶指数为46.35~87.53;均为亲水性蛋白质和不稳定蛋白质。黑果枸杞SPL家族蛋白质结构分析结果表明,无规则卷曲和α-螺旋占比较大。表达模式分析结果表明,在NaCl胁迫下不同器官中黑果枸杞SPL家族基因具有不同的表达趋势,LrSPL9在根和叶中均为高表达。该研究结果可为黑果枸杞SPL基因家族成员盐胁迫响应方面的进一步研究提供参考。

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