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德宏奶水牛SCD基因乳腺组织表达及生物.信息学分析

作  者:
徐维维;庞双龙;徐正尧;王梦迪;唐娜;杨忠;李卫真
单  位:
关键词:
德宏奶水牛;SCD基因;基因表达;生物信息学
摘  要:
本试验旨在研究德宏奶水牛SCD基因表达规律和探究水牛SCD生物学特性.用乳品分析仪测定乳脂率,依照乳脂率高低进行分组,分为高、中、低组(分别为H组、M组、L组).采用qPCR法检测SCD基因表达量,与乳脂率进行关联分析.利用生物信息学方法对水牛SCD的结构进行预测.结果表明,H组SCD表达量极显著高于M组和L组(P<0.01),M组极显著高于L组(P<0.01).其mRNA表达水平与乳脂率呈强正相关.生物信息学分析结果显示,水牛SCD为不稳定亲水蛋白,不存在信号肽,主要在内质网(44.4%)发挥作用.二级结构主要由无规则卷曲(40.39%)、α-螺旋(39.55%)构成.SCD与ELOVL6、SREBP1、FASN等脂质代谢关键分子互作.研究表明,德宏奶水牛SCD基因的表达可能影响乳脂合成.
译  名:
Expression and Bioinformatics Analysis of SCD Gene in Mammary Tissue of Dehong Dairy Buffalo

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