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青海省同德牦牛的母系遗传多样性及群体遗传结构分析

作  者:
李广祯;马志杰;赵学军;陈生梅;刘书杰;林元;李文浩
单  位:
青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室;青海省同德县农牧和水利局
关键词:
牦牛;mtDNA;D-loop区;遗传多样性;群体结构
摘  要:
[目的]从分子水平上揭示青海省同德牦牛的母系遗传多样性、群体遗传结构和遗传背景.[方法]本研究采用PCR方法和扩增产物双向测序技术,对60头(32♂,28♀)同德牦牛mtDNA D-loop区序列进行了测定.经人工核实校对序列后,使用BioEdit、DnaSP、Ar-lequin和Network等生物信息学软件综合分析其母系遗传多样性、群体遗传结构及系统发育关系.[结果]同德牦牛mtDNA D-loop区序列长度在890-894 bp之间,排除12处插入/缺失后共检测到59处多态位点,其中单一多态位点有17处,简约信息位点42处;根据序列间核苷酸变异共确定了31种单倍型,其中H8为优势单倍型,单倍型多样度为0.935±0.023,核苷酸多样度为0.012±0.006.与青海其他牦牛品种(群体)(如高原、环湖、大通牦牛等)相比,同德牦牛单倍型多样度较高,表明其具有较为丰富的母系遗传多样性.使用MJ法(Me-dian-Joining)构建的网络关系图显示:同德牦牛31种单倍型分布在A、B、C、D和E 5种单倍型组中,且其可分为2大母系支系,表明同德牦牛拥有2个母系起源.[结论]同德牦牛群体具有较丰富的母系遗传多样性,由分布于2个母系遗传分支的5个单倍型组(即A、B、C、D和E)个体组成,具有2个母系起源.
译  名:
Maternal Genetic Diversity and Population Genetic Structure of Tongde Yak in Qinghai Province

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