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Position: Home > Articles > Genotyping and Genetic Diversity Analysis of 47 Flowering Cherry(Cerasus)Germplasms Molecular Plant Breeding 2022,20 (3) 1026-1036

47份樱花种质资源的基因分型和遗传多样性分析

作  者：
严佳文;李建挥;柏文富;禹霖;聂东伶;熊颖;李柏海;吴思政
单  位：
湖南省森林植物园
关键词：
樱花;SNP;遗传多样性;基因分型
摘  要：
为给优异樱花种质的保存和利用提供理论依据,对47份樱花种质资源进行了RAD简化基因组测序,挖掘高一致性的群体SNP,应用RAxML、ADMIXTURE、GCTA、PopGenome和Arlequin 3.0等生物信息学软件进行了系统进化树构建、基因分型分析、主成分分析和核苷酸多样性分析.经过基因型完整性过滤和紧密连锁位点筛选后,共获得79 667个高一致性群体SNP.系统进化、遗传结构和主成分聚类分析结果基本一致,47份种质资源分为8个类群,各类群的核苷酸多样性(π)和平均期望杂合度(He)分别为Ⅰ:0.128 19,0.119 94;Ⅱ:0.139 64,0.130 55;Ⅲ:0.215 5,0.164 73;Ⅳ:0.086 82,0.061 22;Ⅴ:0.095 49,0.069 73;Ⅵ:0.191 22,0.106 1;Ⅶ:0.168 5,0.158 78;Ⅷ:0.290 98,0.183 43.类群Ⅳ与Ⅴ之间的遗传分化程度最高(FST=0.461 289),其次是类群Ⅳ与Ⅵ(FST=0.456 958),类群Ⅶ与Ⅷ之间的分化程度最低(FST=0.097 613),各类群之间的遗传分化均处于中等及以上水平.基因分型结果显示,单一遗传组分的个体有29个(61.70%),含有2或3种遗传组分的个体有18个(38.30%),潜在的种间自然杂交个体有4个.樱花种质资源的遗传多样性丰富,8个类群之间存在明显的遗传分化.通过基因型分析,明确了种间自然杂交后代和人工杂交品种的遗传组分,初步探讨了亲本来源.
译  名：
Genotyping and Genetic Diversity Analysis of 47 Flowering Cherry(Cerasus)Germplasms

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