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鸡BMPR1B基因克隆、生物信息学及组织表达分析

作  者:
张晨曦;赖云强;杨岚;樊学伟;王阳光;李文婷;康相涛
单  位:
河南农业大学
关键词:
鸡;BMPR1B基因;cDNA末端快速扩增技术;生物信息学分析;组织表达
摘  要:
[目的]探究鸡骨形态发生蛋白受体1B(bone morphogenetic protein receptor type 1B,BMPR1B)基因在家禽卵巢发育中的功能.[方法]利用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增BM-PR1B基因cDNA的序列,通过生物信息学软件对其所编码的蛋白理化性质及结构功能进行分析,利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术探究BMPR1B基因在鸡各个组织中的表达情况.[结果]鸡BMPR1B基因存在2种转录本,转录本T1长1925 bp,包含5'UTR 248 bp,编码序列1509 bp,3'UTR 168 bp;转录本T2长度为1754 bp,包含5'UTR 77 bp,编码序列1509 bp,3'UTR 168 bp,编码的蛋白包含502个氨基酸.进化分析表明,鸡BMPR1B基因在进化过程中与火鸡亲缘关系最近,保守性较高.理化性质分析显示,鸡BM-PR1B基因编码蛋白属于不稳定、亲水性蛋白.结构域预测发现,该蛋白存在有1段跨膜结构和1个GS保守结构域,整个二级结构主要由无规卷曲组成,预测含有4个磷酸化位点和2个糖基化位点.组织表达分析显示,BMPR1B基因在鸡的心、肝、脾、肺、肾、胸肌、腿肌和卵巢8个组织中均有表达,且在卵巢组织中表达量最高.[结论]该研究结果为后续深入研究BMPR1B基因在鸡卵巢卵泡发育中的作用奠定基础.
译  名:
Cloning, bioinformatics and tissue expression analysis of chicken BMPR1B gene

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