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贵州6个地方鸡FSHβ基因多态性及生物信息学分析

作  者:
王天松;黄明捷;郭勇;莫先艇;陆静;张勇
单  位:
关键词:
FSHβ基因;单核苷酸多态性;生物信息学;地方鸡种;遗传多样性;分子育种
摘  要:
为了研究促卵泡素β亚基(follicle stimulating hormone, FSHβ)基因在贵州6个地方鸡种中的多态性并进行FSHβ基因生物信息学分析,试验以矮脚鸡、白宜黑鸡、乌蒙凤鸡、高脚鸡、威宁鸡、竹乡鸡为研究对象,分别构建DNA混池,用PCR产物直接测序法检测FSHβ基因多态性,对FSHβ蛋白二级结构、三级结构及基本性质进行生物信息学分析.结果表明:矮脚鸡、白宜黑鸡、乌蒙凤鸡、高脚鸡、威宁鸡和竹乡鸡分别有11,6,7,6,6,3个SNP位点.FSHβ蛋白不稳定且为分泌蛋白,含有信号肽序列,但不是跨膜蛋白.亚细胞定位在分泌通路S上,有一个卷曲螺旋结构(置信值低)和疏水区域,保守结构域在17~123位氨基酸之间.说明贵州6个地方鸡种FSHβ基因具有较高的遗传多样性.

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