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BWEL-SPF鸡基因组内源禽白血病病毒基因插入位点识别和验证

作  者:
王梓一;袁一铭;连玲
单  位:
中国农业大学动物科学技术学院
关键词:
BWEL-SPF鸡;禽白血病病毒E亚群;obsERVer流程;全基因组重测序数据;插入位点
摘  要:
为了探究生物信息学软件识别禽白血病病毒E(Avian leukosis virus subgroup E, ALVE)基因插入位点的准确性,试验采用obsERVer流程和位点特异性PCR方法,测定了3只BWEL-SPF鸡全基因组测序数据中的ALVE基因插入位点,并验证了obsERVer流程预测的准确性。结果表明:在3只BWEL-SPF鸡中共识别到4个ALVE基因插入位点,分别为ALVE1、ALVE3、ALVE9和ALVE15;插入位点上下游序列存在规律性,是由6个碱基的基序构成的重复序列;并且这4个插入位点均可以通过位点特异性PCR方法验证,吻合率为100%。说明obsERVer流程可以准确预测测序数据中的ALVE基因插入位点,在BWEL-SPF鸡中存在多个ALVE基因插入位点。

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