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VRTN和NR6A1基因的因果变异与北京黑猪脊椎数性状的关联分析

作  者:
刘倩;岳静伟;牛乃琪;王立贤;张龙超
单  位:
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
关键词:
北京黑猪;脊椎数;VRTN;NR6A1;
摘  要:
为探索椎骨发育相关(Vertebrae Development Associated,VRTN)基因和核受体亚家族6A组成员1(Nuclear Receptor Subfamily 6 Group A Member 1,NR6A1)基因多态性与北京黑猪群体脊椎数的关联性,筛选脊椎数相关的重要分子标记,本研究利用PCR技术和测序技术检测北京黑猪与胸椎数相关的重要候选基因VRTN和NR6A1的单核苷酸多态性(SNPs)位点,开展群体遗传学分析,并与胸椎数和腰椎数进行关联分析。结果显示:VRTN g.2031120312ins291突变位点在北京黑猪群体中表现为ins/ins、ins/-、-/-3种基因型;g.19034A>C突变位点在北京黑猪群体中表现为AA、AC和CC3种基因型;NR6A1c.748C-T突变位点在北京黑猪群体中仅表现为TT基因型;关联分析结果表明,VRTN g.2031120312ins291位点与北京黑猪的胸椎数和腰椎数无显著相关;g.19034A>C位点在北京黑猪中野生型个体(AA)的胸椎数显著低于突变纯合个体(CC),突变杂合个体(AC)的胸椎数与野生型个体和突变纯合个体差异均不显著;野生型个体(AA)的腰椎数显著高于突变纯合个体(CC),突变杂合个体(AC)的腰椎数与野生型个体和突变纯合个体的腰椎数差异均不显著。综上,VRTN基因g.19034A>C位点可作为潜在的北京黑猪多胸椎数分子标记。

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