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1株C3样奇异变形杆菌烈性噬菌体的生物学特性及基因组分析

作  者:
李淑雅;黄赞;朱伟云;林焱
单  位:
国家动物消化道营养国际联合研究中心江苏省消化道营养与动物健康重点实验室南京农业大学消化道微生物研究室
关键词:
奇异变形杆菌;噬菌体;C3;生物学特性;基因组学;
摘  要:
从仔猪粪样中分离鉴定奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)的烈性噬菌体,并对其进行生物学特性分析和基因组分析。以Proteus mirabilis为宿主菌,用双层平板法从仔猪粪样中分离噬菌体。利用电子显微镜观察噬菌体大小和形态。提取噬菌体DNA,并使用Illumina Hiseq进行高通量测序,对基因组进行注释和分析。结果显示:分离到的奇异变形杆菌噬菌体命名为vBPmiPP59(Proteus mirabilis phage vBPmiPP59)。P59属于短尾噬菌体科,形态为C3形:头部为扁平的椭圆形,长152 nm,宽54 nm;尾部长约40 nm,宽12 nm。P59的最佳感染复数为0.001;潜伏期为30 min,爆发期为105 min,裂解量为2 754 PFU·cell-1;P59在不高于50℃,pH 5~10时稳定。P59噬菌体基因组全长90 187 bp,(G+C)%含量为34.65%,共编码136个ORF和4个tRNA,不携带抗生素抗性基因和毒力基因。蛋白质组分析表明,P59与C3样噬菌体phiEco32有30.47%的一致性。奇异变形杆菌噬菌体vBPmiPP59属于C3样烈性噬菌体,并对奇异变形杆菌有显著的抑菌效果。

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