Position: Home > Articles > Characteristics and phylogenetic analysis of the mitochondrial genome in Palinuridae
Journal of Fishery Sciences of China
2022,29
(4)
525-534
龙虾科物种线粒体基因组特征和系统发育分析
作 者：
朱雷宇;朱志煌;朱陇强;林琪
单 位：
上海海洋大学水产与生命学院;福建省水产研究所
关键词：
龙虾科;线粒体基因组;结构特征;系统发育
摘 要：
综合分析了龙虾科(Palinuridae)13个物种线粒体基因组的全序列,发现其线粒体基因组的长度为15470~16105 bp,A+T含量为62.63%~67.11%.Ka/Ks分析表明,龙虾科中的10个龙虾属(Panulirus)物种线粒体13个蛋白质编码基因(protein-coding genes,PCGs)的Ka/Ks<<1,显示出很强的纯化选择;在差异位点的分析中,发现nd5、nd4、rrnL基因的差异位点比例较高,是理想的分子标记,可用于分析龙虾类不同群体之间的遗传多样性;密码子偏好性分析表明,被编码的氨基酸偏好性是相似的.同时,本研究采用ML(maximum likelihood)和BI(Bayesian inference)方法构建系统发育树,结果显示,塔斯马尼亚龙虾属(Sagmiariasus)物种最先开始分化,而龙虾属单独聚为一支,且与脊龙虾属(Linuparus)/游龙虾属(Puerulus)互为姊妹关系.贝叶斯分子钟估算结果显示,龙虾科物种可能起源于三叠纪,随后进一步分化为具有现代表征的龙虾种类.本研究旨在为快速鉴定龙虾科生物提供可靠的分子标记,并为分析龙虾科物种遗传多样性提供理论依据.
译 名：
Characteristics and phylogenetic analysis of the mitochondrial genome in Palinuridae
导出引用
计量
文章访问数: 11
HTML全文浏览量: 0
PDF下载量: 0
所属期刊
