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拟南芥START结构域亚家族生物信息学分析及功能

作  者:
李晓凯;刘霞;常红娟;王凤茹
单  位:
河北省植物生理与分子病理学重点实验室/河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室
关键词:
拟南芥;START结构域;生物信息学分析;生长发育;
摘  要:
START(The Steroidogenic Acute Regulatory Protein-related Lipid Transfer)结构域广泛存在于动物和植物中,参与脂质分子的转移,发挥多种生物学功能。为明确拟南芥START结构域家族成员的结构特征及功能机制,本研究以拟南芥START结构域亚家族为研究对象,通过生物信息学对该家族成员的进化关系、理化性质、基因结构、启动子顺式作用元件进行分析比较,在此基础上,通过qRT-PCR技术,对仅含START结构域亚家族成员在拟南芥发育不同组织表达特性进行了分析,通过分析仅含START结构域亚家族成员的功能获得和功能缺失的转基因拟南芥幼苗形态,确定该亚家族成员对拟南芥幼苗生长的调控作用。结果发现,拟南芥START结构域家族共有35个成员,仅含START结构域亚家族9个成员,但在进化树分析中At4g26920和At5g07260与其余7个成员不在同一分枝中,且其疏水性结合位点不同。仅含START结构域亚家族成员中仅有At3g23080不稳定系数小于40,较为稳定,多数成员均为不稳定蛋白质。基因表达分析表明仅含START结构域亚家族成员具有明显的组织特异表达特性,参与调控幼苗生长发育,为深入探究START结构域调控植物生长发育的生物学功能和作用机制奠定了基础。

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