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Molecular Plant Breeding
2020
(19)
6424-6432
山核桃MITE序列识别和MITE-PCR反应体系的建立
作 者：
夏晓庆;董昂;曾燕如
单 位：
浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室
关键词：
山核桃(Carya cathayensis);转座子;MITE
摘 要：
微型反向重复转座元件(miniature inverted repeat transposable elements, MITEs)在植物中广泛分布,可产生适应性的遗传变异,尤其可在非重组无性繁殖物种中产生变异,可用于遗传多样性分析.为促进山核桃的遗传学研究,本研究运用MITE Digger软件对山核桃基因组测序数据进行扫描,共识别得到739条山核桃MITE序列.基于MITE序列,使用Primer-BLAST在线设计引物680对,占MITE序列的92.02%.基于小麦的MITE-PCR体系,通过降低退火温度5℃优化了山核桃的反应体系.随机挑选300对引物进行筛选,其中108对引物具有稳定的扩增产物.108对引物中100对引物在不同单株山核桃个体中扩增呈现单条带,占92.6%,8对引物扩增呈现双条带,占7.4%.PCR产物测序结果发现,呈现单条带的PCR扩增产物均包含MITE序列,但呈现双条带的PCR扩增产物中大多不含有MITE序列.研究结果为山核桃遗传多样性研究提供了科学依据.
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