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Position: Home > Articles > 暗纹东方鲀leptin基因的克隆、SNP筛选及其与生长性状的关联分析 Journal of Dalian Ocean University 2021 (2) 207-213

暗纹东方鲀leptin基因的克隆、SNP筛选及其与生长性状的关联分析

作  者：
余云登;朱浩拥;王盛南;王耀辉;马文超;杨晓;朱永祥;钱晓明;王秀利
单  位：
江苏中洋集团;大连海洋大学水产与生命学院
关键词：
暗纹东方鲀;瘦素基因;基因克隆;SNP;生长性状;关联分析;
摘  要：
为明确暗纹东方鲀Takifugu20obscurus瘦素（Leptin）基因的基本性质,并探究leptin基因的多态性及其与暗纹东方鲀生长的相关性,随机选择6尾健康的3月龄暗纹东方鲀幼鱼作为基因克隆的试验样本,采用RT-PCR方法克隆leptin基因的cDNA序列,随机选择同期繁殖、同塘养殖的178尾8月龄鱼,采用直接测序法筛选leptin基因中与生长相关的SNP位点。结果表明:克隆得到的leptin20cDNA序列长为66120bp,包括45920bp的开放阅读框,共编码152个氨基酸,Leptin氨基酸序列含19个氨基酸的信号肽序列,推测该蛋白为亲水的稳定蛋白;暗纹东方鲀Leptin氨基酸序列与红鳍东方鲀Leptin氨基酸序列一致性最高,为96.7%,与不同种属的其他鱼类相似性较低,与草鱼氨基酸序列的一致性仅为25.25%,但不同物种的Leptin存在较高的三级结构相似性;在暗纹东方鲀leptin基因上筛选得到2个分型稳定的SNP位点（T24G、T193A）,其中,T24G位点不同基因型个体间的体质量存在显著性差异（P<0.05）,20GG基因型个体体质量显著小于TG和TT基因型（P<0.05）;将2个SNP位点的不同基因型进行组合,经关联分析获得优势双倍型D5,D5型个体的3个生长性状值最高,体质量显著高于D2、D4型个体（P<0.05）,极显著高于D6型个体（P<0.01）,体长和体全长显著高于D6型个体（P<0.05）。研究表明,T24G位点的TG和TT基因型及双倍型D5是暗纹东方鲀优势生长的基因型,可作为暗纹东方鲀辅助育种的候选分子标记。

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