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Position: Home > Articles > Genetic relationship analysis of Cinnamomum camphora and its related species Journal of Fujian Agriculture and Forestry University(Natural Science Edition) 2022,51 (2) 204-209

香樟及近缘种的亲缘关系分析

作  者:
向双;孙维红;万晓会;丁乐;韩国勇;邹双全;邹小兴
单  位:
福建农林大学林学院;福建省林业调查规划院;福州植物园
关键词:
香樟;SNP标记;亲缘关系
摘  要:
基于全基因组重测序技术开发的SNP标记,对香樟及近缘种的亲缘关系进行分析,结果表明,通过对16个香樟无性系和2个近缘种进行重测序分析,共获得209 Gb原始数据,平均有效测序深度16×.共获得约209308831个高质量SNP,纯合SNP共165814908个,杂合SNP共43493923个.由系统进化树可知11份芳樟无性系聚在一起,3份芳樟无性系与油樟聚在一起,然后与龙脑樟聚在一起,沉水樟和肉桂先被分离出来;通过主成分分析将16份香樟无性系分为3类,分别为芳樟类群、龙脑樟和油樟类群;芳樟、龙脑樟和油樟精油成分存在差异,为不同的化学利用类型.
译  名:
Genetic relationship analysis of Cinnamomum camphora and its related species

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