杂交障碍分为受精前障碍与受精后障碍。受精前障碍主要表现为：花粉在柱头上不能萌发；即使花粉在柱头表面萌发，但花粉管不能伸入柱头；花粉管可以穿过柱头在花柱中生长但生长受阻，不能进入子房到达胚囊；花粉管虽能达到胚囊，但不能完成双受精^[6]。受精后障碍主要表现为受精后的合子不分裂或原胚发育异常或早期发育停止；胚乳发育异常或胚乳与胚发育不协调，最终导致胚体发育异常而降解；可获得种子但种子不能发芽或发芽后成株前夭亡或不能正常开花和结果^[7]。

本研究中含笑×金叶含笑杂交的坐果率较高，达78.8%。平均每个果序上有49.4%的蓇葖膨大，当果序上有极少数蓇葖膨大时依然可以实现坐果。然而结籽率却较低，仅为27.3%，平均单个蓇葖内含种子数为1.1个，含笑的每心皮内含2枚胚珠，有近一半的胚珠没有成功受精或受精后胚发育异常。综合分析，在荧光显微观察中发现的花柱道细胞和间隙间堆积了大量胼胝质，阻碍了花粉管的生长；花粉管在柱头表面杂乱生长，导致花粉管无法汇聚成束进入花柱道，最终停止生长；花粉管内部和先端有胼胝质堆积，形成胼胝质塞，使花粉管生长受阻等障碍与结实情况，认为上述杂交障碍并不影响坐果，而是影响结籽。王亚玲^[8]发现花粉管两型性在木兰科植物中广泛存在，绝大多数花粉是短花粉管型，极少数是长花粉管型，而只有长花粉管能完成受精。香港木兰M. championii的花粉大量萌发，在花柱道汇聚成束后，随着花粉管生长，越靠近胚珠的花粉管neng数量越少，仅有少数花粉管能到达胚珠。这种现象与本研究中含笑和紫花含笑的胚珠附近未见明显的花粉管分离现象相似。因此推测：可能是由于花粉的生理特性加上胼胝质阻碍花粉管进入胚珠完成受精，进而影响结籽率。也有研究发现木兰科植物存在大孢子发生和雌配子体发育异常的现象^[9−11]，这会对木兰科植物结实产生影响。

金叶含笑×紫花含笑坐果率与结籽率显著高于紫花含笑×金叶含笑，可见金叶含笑作母本时表现亲和，而作父本时亲和性较差。目前已有许多学者发现杂交亲和性具有单向性^[12−14]。在王亚玲^[8]研究中，紫花含笑×金叶含笑的坐果率为0，判定紫花含笑和金叶含笑杂交不亲和。本研究证实该杂交组合坐果率虽然很低，但仍可以结实。产生差异的原因可能是由于王亚玲仅对7朵花进行杂交试验，样本量过少。虽然在紫花含笑×金叶含笑中出现花粉在柱头表面未萌发，花粉管在柱头表面盘旋生长，未进入柱头，花粉管内部、先端堆积胼胝质而变得膨大，生长受阻，花粉管在胚珠内弯曲缠绕成团，阻碍受精等不亲和现象，但经观察发现绝大多数金叶含笑的花粉管已到达紫花含笑胚珠部位。杨占辉等^[15]在鸢尾Iris spp.杂交试验中发现鸢尾花粉在柱头表面缠绕扭曲，但对花粉管伸长影响不大，最终都可见花粉管进入胚珠。何兴波等^[16]发现‘风味玫瑰’Prunus domestica × P. armeniaca ‘Fengweimeigui’自交的花粉管在胚珠附近时，花粉管先端出现团状胼胝质，阻碍花粉管进入胚珠。张赛阳等^[17]发现杂交石竹Dianthus hybridus的花粉管即使可以从珠孔进入胚囊，但在珠孔附近卷曲盘绕生长，并堆积胼胝质，阻碍双受精。在紫花含笑×金叶含笑杂交1个月后，紫花含笑的雌蕊群上仅有极少数雌蕊膨大，但未落果。在2个月时大多数雌蕊的颜色由绿色转为黄色，随后脱落。当下层雌蕊脱落时会连带上层膨大的雌蕊一起脱落，果实脱落率高达93.34%。王亚玲^[8]发现没有完成双受精的香港木兰雌蕊会在授粉后10 d左右开始凋落。也有学者认为：在授粉后子房生长停滞并大量落果，是胚胎发育不良引起的^[18−19]。吴美娇等^[20]发现百合Lilium spp.花粉管在受精前无明显障碍，但在受精和胚胎发育过程中出现不同程度的胚败育现象。综合分析，推测紫花含笑×金叶含笑杂交不亲和主要是由受精后障碍引起的，因此，需要对受精情况和胚胎发育进一步研究。

在金叶含笑×含笑与金叶含笑×紫花含笑中均存在形态异常的种子，大多数为空瘪的种子。在2个组合中形态异常种子占比分别为9.6%和16.1%，而反交则均为饱满的种子，王亚玲^[8]发现：在香港木兰授粉后部分合子出现败育，如果胚乳核继续发育，最后可以形成无胚种子。同时也存在受精胚乳核败育，胚乳没有形成营养丰富的胚乳核细胞，而是形成海绵状物质。目前已有许多方法用于克服受精前障碍，如蒙导法、重复授粉法等。贺丹等^[21]研究发现：延迟授粉法可以减缓甚至克服母本柱头或花柱对异源花粉萌发及花粉管生长的抑制，克服受精前障碍，提高育种效率。对于杂交胚早期败育可采用胚抢救的方法^[22−23]。因此，在今后研究中可对紫花含笑×金叶含笑的杂交胚采取胚抢救的方法克服不亲和障碍。